More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1917 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
310 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  54.8 
 
 
294 aa  310  2e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  38.2 
 
 
267 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  34.07 
 
 
282 aa  135  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
299 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  25.78 
 
 
291 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
305 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 
316 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
297 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  30.63 
 
 
297 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  32.51 
 
 
304 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 
302 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
306 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
309 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
309 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
300 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
291 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 
285 aa  96.3  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
304 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
304 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
304 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  27.59 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  26.79 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04010  hypothetical protein  38.1 
 
 
546 aa  80.5  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.439585  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
545 aa  76.3  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0189  alpha/beta family hydrolase  27.8 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05308  conserved hypothetical protein  44.16 
 
 
137 aa  63.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 
586 aa  63.2  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 
248 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  26.41 
 
 
290 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  36.5 
 
 
328 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.84 
 
 
288 aa  62.4  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
588 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
278 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  35.77 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  35.77 
 
 
372 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 
288 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
289 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
264 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
325 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  35.88 
 
 
287 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  37.29 
 
 
273 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  37.29 
 
 
273 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 
291 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0334  alpha/beta hydrolase  23.9 
 
 
277 aa  56.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
275 aa  56.2  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
289 aa  55.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
274 aa  55.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
328 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 
292 aa  55.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  23.66 
 
 
285 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2975  Alpha/beta hydrolase  27.17 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  30.89 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  30.89 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  30.89 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  30.89 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2352  alpha/beta hydrolase  27.82 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.517024  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  30.89 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.61 
 
 
368 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.61 
 
 
368 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.9 
 
 
368 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  30.89 
 
 
324 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 
256 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
277 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
277 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
277 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  32.21 
 
 
272 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 
269 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  32.48 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  33.94 
 
 
271 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  24.16 
 
 
273 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
303 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  26.54 
 
 
273 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  24.09 
 
 
322 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1032  hypothetical protein  30 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.137185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4081  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.555861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>