More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4965 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  100 
 
 
308 aa  608  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4387  proline iminopeptidase  51.92 
 
 
326 aa  306  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2620  proline iminopeptidase  52.56 
 
 
320 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000526602  normal  0.51631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8864  Prolyl aminopeptidase  46.79 
 
 
319 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  48.88 
 
 
311 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2058  proline iminopeptidase  46.15 
 
 
324 aa  267  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2056  proline iminopeptidase  44.55 
 
 
324 aa  261  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1856  proline iminopeptidase  43.89 
 
 
322 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.0201858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1352  proline iminopeptidase  46.91 
 
 
312 aa  258  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.800954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  46.96 
 
 
332 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  45.61 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2191  prolyl aminopeptidase  44.16 
 
 
321 aa  252  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.73475  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  45.45 
 
 
319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  45.76 
 
 
326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  43.62 
 
 
318 aa  242  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0084  prolyl aminopeptidase  43.27 
 
 
318 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  45.27 
 
 
320 aa  240  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  43.77 
 
 
310 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5441  proline iminopeptidase  42.62 
 
 
327 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139374  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  44.75 
 
 
320 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  44.73 
 
 
312 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  44.73 
 
 
312 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  43.45 
 
 
321 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  44.09 
 
 
310 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  44.41 
 
 
429 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  44.09 
 
 
310 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  44.73 
 
 
312 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  44.41 
 
 
429 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  44.41 
 
 
429 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  44.09 
 
 
310 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  41.67 
 
 
320 aa  235  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  44.09 
 
 
436 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  43.13 
 
 
310 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  43.13 
 
 
310 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  43.77 
 
 
318 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  42.81 
 
 
310 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  44.75 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  44.75 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  43.13 
 
 
329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  41.02 
 
 
316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  41.02 
 
 
316 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  41.02 
 
 
316 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  45.95 
 
 
321 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  44.75 
 
 
317 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  43.85 
 
 
328 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  43.77 
 
 
414 aa  229  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  38.89 
 
 
330 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  44.03 
 
 
328 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  40.88 
 
 
314 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  41.28 
 
 
320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  40.76 
 
 
321 aa  224  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  41.56 
 
 
326 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  42.86 
 
 
312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  41 
 
 
320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  41.21 
 
 
315 aa  218  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  41.67 
 
 
313 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1479  proline iminopeptidase  42.95 
 
 
321 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  40 
 
 
317 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01230  proline iminopeptidase  40.13 
 
 
325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  39.26 
 
 
323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  39.93 
 
 
323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1042  proline iminopeptidase  42.67 
 
 
316 aa  216  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  40.74 
 
 
316 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  40.74 
 
 
342 aa  215  5.9999999999999996e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0717  proline iminopeptidase  41.28 
 
 
320 aa  215  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.922147  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  39.26 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  40.26 
 
 
323 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  39.87 
 
 
313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  43.2 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  43.38 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  38.59 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  37.7 
 
 
323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  40 
 
 
316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  40.53 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.624874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  37.7 
 
 
323 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  37.7 
 
 
323 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3255  proline iminopeptidase  43.58 
 
 
315 aa  212  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.189812  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  40.32 
 
 
316 aa  212  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  39.87 
 
 
313 aa  212  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  37.9 
 
 
323 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  39.56 
 
 
313 aa  211  9e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  36.27 
 
 
315 aa  211  2e-53  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  37.92 
 
 
323 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  38.24 
 
 
316 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  36.94 
 
 
323 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  42.24 
 
 
329 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  38.8 
 
 
320 aa  205  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  36.1 
 
 
333 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  34.33 
 
 
323 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  36.94 
 
 
319 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36840  proline iminopeptidase  43.09 
 
 
316 aa  202  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0362084  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  33.56 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  33.56 
 
 
316 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1122  proline iminopeptidase  38.41 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  33.56 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3085  proline iminopeptidase  38.44 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  32 
 
 
313 aa  195  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1737  proline iminopeptidase  40.74 
 
 
316 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146462  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  39.6 
 
 
328 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0523  prolyl aminopeptidase  35.96 
 
 
316 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.870437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>