More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0437 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  97.83 
 
 
323 aa  658    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  100 
 
 
323 aa  669    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  97.83 
 
 
323 aa  658    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  97.52 
 
 
323 aa  657    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  91.33 
 
 
323 aa  617  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  86.38 
 
 
323 aa  590  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  86.07 
 
 
323 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  85.76 
 
 
323 aa  588  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  82.24 
 
 
323 aa  567  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  81.31 
 
 
323 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  66.67 
 
 
316 aa  458  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  62.54 
 
 
323 aa  448  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  62.97 
 
 
320 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  64.13 
 
 
323 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  60.32 
 
 
328 aa  415  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0168  proline iminopeptidase  56.13 
 
 
323 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  56.63 
 
 
310 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  56.96 
 
 
310 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  57.19 
 
 
313 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  56.55 
 
 
313 aa  378  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  58.01 
 
 
313 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  57.69 
 
 
313 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  58.71 
 
 
320 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  55.1 
 
 
320 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  56.31 
 
 
310 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  56.31 
 
 
310 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  56.31 
 
 
310 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1122  proline iminopeptidase  56.87 
 
 
316 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  55.66 
 
 
310 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  55.66 
 
 
310 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  54.66 
 
 
321 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  54.14 
 
 
320 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  54.05 
 
 
329 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  54.6 
 
 
314 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  55.77 
 
 
326 aa  363  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.624874 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  54.66 
 
 
326 aa  362  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  55.59 
 
 
316 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  56.77 
 
 
429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  56.77 
 
 
429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  56.77 
 
 
429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  55.81 
 
 
414 aa  361  9e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  56.45 
 
 
312 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  56.45 
 
 
312 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  56.45 
 
 
436 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  56.45 
 
 
312 aa  359  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  54.72 
 
 
318 aa  358  7e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  55.66 
 
 
321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0717  proline iminopeptidase  53.18 
 
 
320 aa  354  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.922147  normal  0.435096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  53.61 
 
 
319 aa  352  5e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4027  prolyl aminopeptidase  52.08 
 
 
318 aa  351  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  53 
 
 
319 aa  350  2e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  53.53 
 
 
316 aa  348  5e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  52.85 
 
 
326 aa  348  6e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  52.06 
 
 
317 aa  348  8e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  53.53 
 
 
342 aa  348  8e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1479  proline iminopeptidase  51.75 
 
 
321 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  50.96 
 
 
317 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  53.67 
 
 
316 aa  346  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  52.4 
 
 
316 aa  345  5e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04709  prolyl aminopeptidase protein  52.24 
 
 
320 aa  342  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  53.72 
 
 
329 aa  342  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  52.06 
 
 
321 aa  342  4e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  52.08 
 
 
316 aa  342  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  51.27 
 
 
317 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  51.27 
 
 
317 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  52.08 
 
 
316 aa  341  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1807  hypothetical protein  47.63 
 
 
319 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1808  hypothetical protein  47.32 
 
 
319 aa  337  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  51.27 
 
 
320 aa  335  7.999999999999999e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  51.94 
 
 
320 aa  334  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  49.85 
 
 
330 aa  333  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  50.79 
 
 
315 aa  331  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  50.16 
 
 
333 aa  330  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  50.31 
 
 
332 aa  329  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  52.88 
 
 
311 aa  328  7e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  49.84 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0523  prolyl aminopeptidase  49.21 
 
 
316 aa  325  7e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.870437  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12631  hydrolases or acyltransferases  49.21 
 
 
316 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  49.02 
 
 
316 aa  321  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  48.21 
 
 
316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  46.5 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  48.08 
 
 
318 aa  318  7e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  47.88 
 
 
316 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1737  proline iminopeptidase  52.38 
 
 
316 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146462  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3951  proline iminopeptidase  46.35 
 
 
322 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  49.35 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  47.12 
 
 
316 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  45.92 
 
 
335 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2836  proline iminopeptidase  49.68 
 
 
321 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  48.73 
 
 
322 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1174  prolyl aminopeptidase  49.36 
 
 
321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0084  prolyl aminopeptidase  48.4 
 
 
318 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1042  proline iminopeptidase  50.65 
 
 
316 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  47.67 
 
 
313 aa  302  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  46.03 
 
 
319 aa  295  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3255  proline iminopeptidase  49.35 
 
 
315 aa  290  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.189812  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  45.08 
 
 
313 aa  289  4e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  45.31 
 
 
325 aa  285  7e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  40.31 
 
 
318 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1402  proline iminopeptidase  45.76 
 
 
322 aa  275  6e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>