More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3302 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 275 aa  522  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  47.97 
 
 		 278 aa  225  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  45.2 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  39.29 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  39.49 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  35.84 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  37.13 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  35.74 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  31.77 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 		 304 aa  89.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  31.58 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  27.54 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  29.75 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  32.91 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  26.96 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  28.63 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  29.12 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  30.37 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  29.23 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  31.17 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0194  Alpha/beta hydrolase  28.95 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  33.73 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  29.7 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  28.02 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1087  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0532953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  28.85 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1660  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2396  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.35 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  38.74 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  28.81 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3925  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182869  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  26.01 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3920  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  26.9 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0185  Alpha/beta hydrolase  27.8 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  28.11 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  28.67 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.01 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>