More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0087 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  599  1e-170  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  37.67 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  32.84 
 
 
308 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  33.21 
 
 
295 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  32.01 
 
 
282 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
309 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
309 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  28.33 
 
 
304 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
302 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
297 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  29.93 
 
 
297 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 
321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
306 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
296 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
304 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
304 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
304 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
304 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 
285 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
291 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
316 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
279 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 
304 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
310 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 
294 aa  102  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 
310 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
302 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  30.82 
 
 
297 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
586 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
290 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 
278 aa  92.8  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05308  conserved hypothetical protein  46.43 
 
 
137 aa  86.7  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0334  alpha/beta hydrolase  24.81 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.93 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
545 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
588 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.62 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0138  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  23.26 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  23.97 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1000  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000731693  hitchhiker  0.000000950161 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.3 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  24.81 
 
 
324 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  22.52 
 
 
300 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04010  hypothetical protein  30.77 
 
 
546 aa  62.4  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.439585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.62 
 
 
300 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  21.19 
 
 
248 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  22.92 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44260  predicted protein  22.87 
 
 
368 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  23.05 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.19 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  25.28 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
311 aa  60.1  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 
276 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 
276 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  22.37 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
314 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  22.59 
 
 
300 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  27.46 
 
 
273 aa  59.3  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  26.77 
 
 
274 aa  58.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  24 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  23.78 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155441  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  22.26 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  22.26 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  23.76 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  23.76 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6615  Alpha/beta hydrolase  40 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 
272 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  23.48 
 
 
276 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  23.49 
 
 
277 aa  56.2  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 
276 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 
281 aa  55.8  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  23.88 
 
 
274 aa  55.8  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  31.65 
 
 
282 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  31.65 
 
 
282 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
275 aa  55.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  24.38 
 
 
322 aa  55.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  35.45 
 
 
325 aa  55.8  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
299 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
277 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
299 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>