85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0077 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
289 aa  570  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  92.39 
 
 
289 aa  535  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0138  alpha/beta hydrolase fold protein  68.53 
 
 
288 aa  334  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  62.12 
 
 
297 aa  301  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  28.32 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  29.39 
 
 
295 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  30.6 
 
 
308 aa  99  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  33.33 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
302 aa  96.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  35.09 
 
 
279 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  31.19 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
302 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
586 aa  86.7  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  32.36 
 
 
300 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
282 aa  77  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
304 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
304 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
588 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  40.37 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
275 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
310 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  38.83 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  26.78 
 
 
248 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
321 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0189  alpha/beta family hydrolase  35.85 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
316 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0334  alpha/beta hydrolase  29.52 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05308  conserved hypothetical protein  37.93 
 
 
137 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  31.15 
 
 
328 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  29.92 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04010  hypothetical protein  34.74 
 
 
546 aa  47  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.439585  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  31.58 
 
 
333 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  31.25 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
268 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
290 aa  45.8  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
404 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  25.66 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  32 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  29.31 
 
 
311 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  24.83 
 
 
273 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  28.21 
 
 
323 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  32.47 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  31.25 
 
 
326 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.624874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0078  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
197 aa  43.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 
324 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  36.36 
 
 
324 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 
324 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 
324 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 
310 aa  42.7  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35 
 
 
371 aa  42.7  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 
327 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 
324 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
275 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  30.92 
 
 
284 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2056  proline iminopeptidase  27.78 
 
 
324 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
276 aa  42.4  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  24.55 
 
 
285 aa  42.4  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>