100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0189 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0189  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 		 314 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  26.52 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  28.06 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 586 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  23.6 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3058  Prolyl aminopeptidase  34.67 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 282 aa  52.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 270 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0138  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 288 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 321 aa  49.7  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 316 aa  49.7  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  23.1 
 
 		 295 aa  49.3  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0503  proline iminopeptidase  27.03 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.624874 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  30.1 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  31.71 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 588 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2584  putative prolyl aminopeptidase  37.58 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.35326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  47.54 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  32.35 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  27.59 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  25.46 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 545 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 273 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  31.9 
 
 		 312 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  31.9 
 
 		 312 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  31.9 
 
 		 312 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  32.32 
 
 		 429 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  32.32 
 
 		 429 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  32.32 
 
 		 429 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 253 aa  46.2  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  28.89 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  31.71 
 
 		 436 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8864  Prolyl aminopeptidase  28.38 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  25.14 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  25.14 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  40.54 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  25.76 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  25.14 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  30.16 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  30.99 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  27.33 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  30.25 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 394 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  27.27 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  24.64 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.65 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05308  conserved hypothetical protein  40.98 
 
 		 137 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  27.06 
 
 		 257 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  27.06 
 
 		 257 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  27.06 
 
 		 257 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4358  proline iminopeptidase  28.57 
 
 		 361 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0513684  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  29.55 
 
 		 332 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  27.66 
 
 		 317 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  31.67 
 
 		 312 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 239 aa  42.7  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.02 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  27.34 
 
 		 312 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  31.03 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  24.77 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5970  prolyl aminopeptidase  35.17 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.0116459 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  30.4 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 297 aa  42.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  27.95 
 
 		 310 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  28.93 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  24.34 
 
 		 288 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 		 257 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  27.06 
 
 		 257 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>