223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2299 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 296 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  38.97 
 
 		 299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  29.12 
 
 		 291 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  36.52 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  37.87 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  36.09 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  37.41 
 
 		 304 aa  145  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 		 321 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  34.86 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  34.49 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  34.49 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  30.71 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  36.76 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  39.3 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  35.62 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  37.35 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 294 aa  105  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  32.29 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 289 aa  89.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 278 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  33.1 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05308  conserved hypothetical protein  48.15 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0189  alpha/beta family hydrolase  27.72 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 545 aa  60.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 586 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3529  3-oxoadipate enol-lactonase  30.3 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04010  hypothetical protein  36.79 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.439585  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  23.15 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  32.32 
 
 		 578 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 588 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 264 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  34.38 
 
 		 568 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  22.82 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  22.82 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  22.41 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 265 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  22.48 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  22.48 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  23.96 
 
 		 313 aa  49.3  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 289 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.76 
 
 		 288 aa  49.3  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  27.54 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  28.34 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  25.1 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44260  predicted protein  40.48 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3058  Prolyl aminopeptidase  36.22 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0334  alpha/beta hydrolase  22.09 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  30.77 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.33 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  30.16 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  25.47 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1122  proline iminopeptidase  31.25 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  27.4 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  23 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.33 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3255  proline iminopeptidase  31.58 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.189812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0138  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  24.92 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.48 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>