98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1109 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
248 aa  487  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  46.44 
 
 
275 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  42.62 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  39.53 
 
 
298 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  34.33 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 
290 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 
316 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 
285 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  36.71 
 
 
279 aa  95.9  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
297 aa  95.5  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  32.33 
 
 
297 aa  95.5  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 
291 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  29.32 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
302 aa  79  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
305 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 
304 aa  78.6  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
299 aa  77  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
304 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
304 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
304 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  26.17 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
289 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  21.19 
 
 
291 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  29.3 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
321 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  25.81 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 
289 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 
282 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
310 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
296 aa  55.1  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 
324 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.13 
 
 
261 aa  52.4  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 
310 aa  52.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
260 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  26.58 
 
 
304 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0138  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  23.37 
 
 
311 aa  49.7  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.18 
 
 
263 aa  49.3  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
264 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.03 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2975  Alpha/beta hydrolase  27.92 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1315  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  25.72 
 
 
381 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  27.94 
 
 
262 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  26.1 
 
 
261 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  21.4 
 
 
331 aa  46.2  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2233  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
300 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
311 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
284 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1032  hypothetical protein  32.5 
 
 
299 aa  45.8  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.137185 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0820  homoserine O-acetyltransferase  47.27 
 
 
357 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.602432  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.29 
 
 
256 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  34.07 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  23.21 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  27.08 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  25.87 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.61 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  25.71 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44260  predicted protein  23.64 
 
 
368 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  33.33 
 
 
396 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
346 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2222  alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 
301 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  27.75 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  29.52 
 
 
255 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  22.65 
 
 
281 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  34 
 
 
265 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  27.3 
 
 
297 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  42.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4596  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
260 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
286 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
259 aa  42  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
271 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
334 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
345 aa  42  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  23.86 
 
 
254 aa  42  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>