More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3278 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
305 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  89.04 
 
 
306 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  73 
 
 
304 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  71.48 
 
 
304 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  71.48 
 
 
304 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  71.48 
 
 
304 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  60.54 
 
 
304 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  57.97 
 
 
310 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  46.39 
 
 
309 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  46.39 
 
 
309 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  46.74 
 
 
309 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  42.51 
 
 
321 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  43.9 
 
 
316 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 
299 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  30.45 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
297 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  32.98 
 
 
297 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
300 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  31.2 
 
 
295 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  30.54 
 
 
308 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
291 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
302 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  32.09 
 
 
279 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
285 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
302 aa  99.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
310 aa  94  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
289 aa  90.1  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
586 aa  86.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
289 aa  86.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  39.84 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
275 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
248 aa  79  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0334  alpha/beta hydrolase  26.64 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  35.38 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  32.09 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  31.34 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  32.09 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  30.66 
 
 
323 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  30.66 
 
 
323 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  31.34 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  31.34 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04010  hypothetical protein  32.79 
 
 
546 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.439585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  30.66 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  32.72 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  31.75 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  31.37 
 
 
332 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0189  alpha/beta family hydrolase  26.92 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44260  predicted protein  43.9 
 
 
368 aa  56.6  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05308  conserved hypothetical protein  36.47 
 
 
137 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  29.04 
 
 
324 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  29.13 
 
 
313 aa  56.2  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  26.13 
 
 
297 aa  55.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  32.06 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  28.37 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  30.94 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01230  proline iminopeptidase  29.73 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  30.08 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  29.93 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  34.15 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0138  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4543  Alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  25.36 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.62 
 
 
262 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
331 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2975  Alpha/beta hydrolase  25.08 
 
 
302 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  28.35 
 
 
313 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
545 aa  53.1  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  23.64 
 
 
286 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  27.43 
 
 
378 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
272 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
328 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  29.55 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  30.53 
 
 
316 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  29.41 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.44 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
322 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.56 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  28.47 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4400  proline iminopeptidase, putative  27.56 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  30.47 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  30.66 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  34.48 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  30.66 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  30.66 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  29.85 
 
 
316 aa  50.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1402  proline iminopeptidase  31.36 
 
 
322 aa  50.8  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  30.47 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3908  prolyl aminopeptidase  28.23 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.29 
 
 
380 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>