282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0514 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
302 aa  597  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
299 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  28.52 
 
 
291 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  35.21 
 
 
300 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  35.43 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  30.74 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  33.7 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  31.67 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 
282 aa  112  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  33.33 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 
302 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
309 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
309 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  28.97 
 
 
304 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
305 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 
279 aa  99  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
298 aa  96.3  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
291 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 
304 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
306 aa  89  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
586 aa  82.4  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05308  conserved hypothetical protein  41.57 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0189  alpha/beta family hydrolase  38.73 
 
 
314 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
588 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 
273 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04010  hypothetical protein  32.23 
 
 
546 aa  63.2  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.439585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  30 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
287 aa  58.9  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
302 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.17 
 
 
374 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.09 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  36.21 
 
 
284 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
545 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  25.72 
 
 
274 aa  56.2  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44260  predicted protein  25.67 
 
 
368 aa  55.8  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
318 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
318 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  28.99 
 
 
297 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
284 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3920  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 
278 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 
284 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  34.13 
 
 
284 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 
277 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.57 
 
 
369 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
334 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  37.74 
 
 
300 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 
282 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  32.33 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  23.84 
 
 
276 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1660  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  37.6 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
284 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  23.28 
 
 
273 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  25.17 
 
 
395 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0334  alpha/beta hydrolase  25.19 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.34 
 
 
370 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
287 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
320 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  25.32 
 
 
330 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
277 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
273 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
250 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  25.93 
 
 
280 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
250 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
325 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
271 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 
266 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3102  Alpha/beta hydrolase  27.61 
 
 
276 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  36.36 
 
 
286 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>