35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0334 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0334  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  29.8 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  31.02 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  24.81 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  25 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  28.21 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  23.88 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  35.44 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0138  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  41.18 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>