More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7960 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 300 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  54.23 
 
 		 291 aa  288  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  46.62 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  46.48 
 
 		 279 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  43.96 
 
 		 278 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  38.41 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  39.71 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  34.19 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  27.66 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  34.78 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  32.01 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  30.94 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  35.27 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  34.8 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  34.33 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  29.76 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 294 aa  99.4  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 586 aa  95.9  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 		 267 aa  93.6  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  32.36 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0189  alpha/beta family hydrolase  30.47 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  36.42 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  31.49 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  32.48 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  28.83 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  36.09 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  33.33 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  33.33 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  26.3 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  35.04 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1174  prolyl aminopeptidase  35.46 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2836  proline iminopeptidase  35.46 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0129  alpha/beta hydrolase fold  36.22 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0334  alpha/beta hydrolase  25.83 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  33.75 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3707  prolyl aminopeptidase  29.86 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  32.16 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  30.47 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  35.25 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  31.43 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  35.19 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  30.05 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  23.21 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  33.04 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0312  prolyl aminopeptidase  28.47 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.361295  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  36.67 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  33.99 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  38.18 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1380  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5208  alpha/beta hydrolase fold  34.74 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32318  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.47 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0317  prolyl aminopeptidase  28.47 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.463031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  33.33 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>