More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1153 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
299 aa  610  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  37.67 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  38.91 
 
 
308 aa  172  9e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 
282 aa  159  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  38.81 
 
 
296 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
302 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  32.71 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 
305 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 
304 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 
304 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 
309 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 
304 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  29.93 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  29.19 
 
 
304 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  32.85 
 
 
297 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
306 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
297 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
309 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
309 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
321 aa  126  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 
285 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
294 aa  119  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
279 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
298 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
304 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
300 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
291 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
316 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
289 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 
310 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
289 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
267 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 
290 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05308  conserved hypothetical protein  56.96 
 
 
137 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  27.46 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  24.17 
 
 
586 aa  73.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44260  predicted protein  25.49 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  34.57 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0334  alpha/beta hydrolase  26.18 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 
293 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.2 
 
 
380 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  24.59 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1781  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
260 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  38.02 
 
 
332 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04010  hypothetical protein  31.78 
 
 
546 aa  55.8  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.439585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  24.26 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  24.26 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
287 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  26.43 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  26.36 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13198  peroxidase  23.94 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.285642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  23.96 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  24.26 
 
 
300 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  23.93 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
296 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  23.93 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0138  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
288 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
288 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 
330 aa  53.1  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
321 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
287 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.93 
 
 
300 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
335 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 
278 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 
332 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
317 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0189  alpha/beta family hydrolase  31.45 
 
 
314 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
270 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 
332 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  34.78 
 
 
262 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  32.2 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  24.2 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.83 
 
 
371 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.09 
 
 
368 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 
276 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  27.54 
 
 
300 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
270 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  30.58 
 
 
290 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  38.27 
 
 
273 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  29.45 
 
 
356 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
263 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  31.03 
 
 
258 aa  50.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  34 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  22.11 
 
 
273 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>