78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04010 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB04010  hypothetical protein  100 
 
 
546 aa  1125    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.439585  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02030  expressed protein  32.19 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.419318  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  37.72 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  37.78 
 
 
310 aa  67  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 
267 aa  64.3  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
302 aa  63.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  30.77 
 
 
291 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 
304 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 
304 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 
304 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 
309 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 
309 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 
309 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  34.33 
 
 
304 aa  61.2  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  28.07 
 
 
295 aa  59.7  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  33.96 
 
 
304 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 
294 aa  58.9  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 
302 aa  58.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 
305 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
306 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
321 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 
342 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
310 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
299 aa  55.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
273 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  30.7 
 
 
308 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 
300 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
278 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  36.94 
 
 
297 aa  53.9  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 
297 aa  53.9  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
284 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1091  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 
367 aa  53.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0905428  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  29.55 
 
 
327 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  29.66 
 
 
324 aa  51.2  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  36.56 
 
 
285 aa  51.2  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  29.55 
 
 
324 aa  50.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  30.08 
 
 
324 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  29.55 
 
 
324 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  29.66 
 
 
324 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
298 aa  50.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  32.32 
 
 
289 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 
278 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
316 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  33.91 
 
 
390 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  36.96 
 
 
300 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
328 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 
291 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
328 aa  48.9  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
282 aa  48.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
327 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  35.34 
 
 
327 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
327 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 
320 aa  47.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 
325 aa  47.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
273 aa  47.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 
344 aa  47  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  33.71 
 
 
297 aa  47.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  34.74 
 
 
289 aa  47  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
272 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 
304 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0118  alpha/beta fold family hydrolase  29.45 
 
 
326 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1537  alpha/beta fold family hydrolase  29.45 
 
 
326 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  36.79 
 
 
296 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  29.29 
 
 
320 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
322 aa  45.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 
327 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
282 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
311 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05308  conserved hypothetical protein  48 
 
 
137 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
311 aa  44.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
318 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
316 aa  44.3  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
273 aa  43.9  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 
278 aa  43.9  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 
259 aa  43.9  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  31.2 
 
 
350 aa  43.9  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.46 
 
 
380 aa  43.9  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  30.08 
 
 
328 aa  43.5  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>