More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1091 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1091  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
367 aa  715    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0905428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2389  alpha/beta hydrolase fold protein  57.34 
 
 
351 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000065043  decreased coverage  0.000121837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8516  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  62.54 
 
 
337 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0803  alpha/beta hydrolase fold  54.73 
 
 
353 aa  343  2.9999999999999997e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3801  alpha/beta hydrolase fold  51.56 
 
 
351 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  48.9 
 
 
361 aa  312  5.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2128  alpha/beta hydrolase fold protein  46.22 
 
 
356 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0368  alpha/beta hydrolase fold protein  47.75 
 
 
355 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.324688 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1911  alpha/beta hydrolase fold protein  45.07 
 
 
354 aa  293  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00103151  hitchhiker  0.0000592748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  40.59 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  45.28 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1744  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0831035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  34.23 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  45.79 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 
300 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  34.55 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  35.19 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  34.26 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  39.34 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  43.27 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  46.02 
 
 
266 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  33.64 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  37.88 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  33.64 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  38.36 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  36.65 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  33.64 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
282 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 
302 aa  67  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  38.4 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  37.38 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  35.56 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  34.34 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  42.06 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.81 
 
 
293 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  38.18 
 
 
279 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
300 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  35.4 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  37.38 
 
 
262 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  28.12 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  35.2 
 
 
272 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  36.99 
 
 
272 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
255 aa  64.3  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3529  3-oxoadipate enol-lactonase  27.83 
 
 
294 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 
264 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  36.99 
 
 
272 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 
282 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
269 aa  63.5  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 
282 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  36.99 
 
 
272 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5615  alpha/beta hydrolase fold protein  38 
 
 
305 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 
291 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
278 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 
291 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  43.12 
 
 
275 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 
297 aa  63.2  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  41.18 
 
 
279 aa  63.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 
264 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
254 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  34.13 
 
 
268 aa  62.8  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 
273 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  39.42 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 
251 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  43.24 
 
 
275 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  40.87 
 
 
271 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
252 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 
291 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  40.95 
 
 
263 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.17 
 
 
277 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.44 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
273 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.34 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 
284 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  39.64 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  32.61 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  34.38 
 
 
273 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 
291 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 
291 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 
279 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 
281 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  38.83 
 
 
249 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 
286 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3372  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 
287 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000420005  normal  0.0275463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0492  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 
313 aa  60.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  37.19 
 
 
322 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 
268 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 
298 aa  60.1  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>