More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2217 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
297 aa  597  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  100 
 
 
297 aa  597  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  29.93 
 
 
291 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 
300 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  29.92 
 
 
295 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
305 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
299 aa  129  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  37.23 
 
 
296 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
316 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  32.28 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 
302 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
302 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  33.22 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
304 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
304 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
304 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 
309 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
304 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  31.83 
 
 
321 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
291 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  34.2 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 
298 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
586 aa  95.9  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 
248 aa  95.5  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
275 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
310 aa  92.8  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
304 aa  92.8  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
316 aa  92  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
294 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
290 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0334  alpha/beta hydrolase  29.8 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  33.76 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  33.09 
 
 
297 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  37.6 
 
 
272 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  39.52 
 
 
263 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
272 aa  63.2  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
545 aa  62.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  22.54 
 
 
300 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  26.64 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  22.18 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  22.18 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0138  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
288 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  21.83 
 
 
300 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  21.83 
 
 
300 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  21.83 
 
 
300 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
272 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  20.16 
 
 
277 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  21.83 
 
 
300 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.18 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0160  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.18 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5296  alpha/beta hydrolase fold protein  36.76 
 
 
251 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.18 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.67 
 
 
370 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  33.33 
 
 
286 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
286 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
273 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
273 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
273 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0557  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 
299 aa  55.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
271 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  26.28 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  36.04 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  38.38 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  28.37 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  34.95 
 
 
278 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  36.7 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  25.94 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  26.3 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  35.14 
 
 
323 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  34.96 
 
 
250 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04010  hypothetical protein  36.94 
 
 
546 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.439585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0750  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0913521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0764  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116226  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0744  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.477105  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  33.64 
 
 
313 aa  53.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  32.76 
 
 
323 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  34.68 
 
 
287 aa  53.9  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 
272 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
273 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>