More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5296 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5296  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  35.74 
 
 
257 aa  129  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.1 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
226 aa  72  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.47 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
270 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  33.53 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
271 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  35.53 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  26.17 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  27.82 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.93 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  28.68 
 
 
273 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  23.27 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.74 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 
425 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  38.41 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  26.15 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0748  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.67 
 
 
370 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  28.89 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  28.96 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 
305 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 
298 aa  63.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
264 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
287 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0100  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 
285 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  25.42 
 
 
253 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
266 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
257 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  35.97 
 
 
266 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 
278 aa  62.4  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.51 
 
 
270 aa  62  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
263 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 
318 aa  62  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  23.51 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  27.75 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
289 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  38.17 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.71 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  24.11 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  22.83 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  27.01 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  22.83 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2156  alpha/beta family hydrolase  35.77 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.17 
 
 
370 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 
284 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.73 
 
 
392 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
248 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 
318 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  22.8 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
267 aa  59.3  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 
277 aa  59.3  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
272 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
258 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  26.84 
 
 
263 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  40.34 
 
 
309 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
270 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>