More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2156 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2156  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 
297 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  32.58 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.25 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 
250 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2449  alpha/beta fold family hydrolase  27.57 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00496811  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  34.25 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  34.9 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  39.13 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.9 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.9 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4362  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  35.38 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.15 
 
 
370 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.83 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  38.94 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  40.34 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  33.61 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.1 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  38.21 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.6 
 
 
370 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  33.77 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2516  hydrolase, alpha/beta fold family  26.64 
 
 
242 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  38.61 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 
226 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  38.4 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  37.61 
 
 
270 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  33.87 
 
 
340 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2252  alpha/beta fold family hydrolase  26.64 
 
 
242 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0246146  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2417  alpha/beta fold family hydrolase  26.64 
 
 
242 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.286524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
381 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
262 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  31.9 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2435  hydrolase, alpha/beta fold family  26.17 
 
 
242 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 
271 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5296  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  35.83 
 
 
268 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 
259 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  46.05 
 
 
374 aa  60.1  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  33.51 
 
 
258 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
277 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
257 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
277 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
277 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
277 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
265 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.03 
 
 
308 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  38.32 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  36.31 
 
 
267 aa  59.3  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  26.79 
 
 
313 aa  59.3  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.33 
 
 
262 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 
270 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  35.04 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  35.04 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 
274 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  35.04 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  35.04 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  27.71 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.33 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  40.19 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  43.66 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2211  alpha/beta fold family hydrolase  26.42 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000336996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2171  alpha/beta fold family hydrolase  25.7 
 
 
242 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0619801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  33.95 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  33.95 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
250 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
283 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  36.52 
 
 
260 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
262 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  34.19 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  35.04 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 
276 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  34.19 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  34.4 
 
 
328 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 
263 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
254 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  32.12 
 
 
260 aa  56.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  32.12 
 
 
260 aa  56.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>