More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0377 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 258 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  97.29 
 
 		 258 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  89.15 
 
 		 257 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  73.26 
 
 		 254 aa  387  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  69.77 
 
 		 254 aa  364  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  69.38 
 
 		 254 aa  362  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  58.14 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  58.14 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  53.88 
 
 		 255 aa  278  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  57.31 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  51.75 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  51.16 
 
 		 250 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  50.39 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  50.78 
 
 		 250 aa  262  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  50.39 
 
 		 257 aa  260  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  51.94 
 
 		 256 aa  258  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  51.94 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  53.28 
 
 		 251 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 250 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  56.13 
 
 		 261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  52.73 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  52.33 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  52.57 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  51.55 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  51.56 
 
 		 256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  44.71 
 
 		 248 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  43.31 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  36.65 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  39.53 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  31.25 
 
 		 251 aa  99  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  37.76 
 
 		 262 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  29.88 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 		 257 aa  95.1  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5604  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  41.54 
 
 		 340 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  41.54 
 
 		 343 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  30.08 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  33.45 
 
 		 292 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 		 340 aa  89  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  31.25 
 
 		 275 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 		 284 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.32 
 
 		 286 aa  85.9  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  33.05 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.98 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.8 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  30.09 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  29.18 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 		 344 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 332 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  40.77 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  27.92 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  31.92 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  31.58 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  34.5 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  44.12 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  34.86 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  40.31 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  40.74 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3019  putative hydrolase  27.19 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.757431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  43.81 
 
 		 323 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.76 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  29 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  33.14 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  36.55 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.66 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  27.04 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.81 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  36.09 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3745  putative hydrolase  26.75 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>