More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2933 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  85.9 
 
 		 406 aa  663    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 		 377 aa  774    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  75.13 
 
 		 387 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  77.64 
 
 		 344 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  74.54 
 
 		 348 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  76.85 
 
 		 348 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  77.17 
 
 		 353 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  74.84 
 
 		 353 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  76.53 
 
 		 387 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  76.53 
 
 		 353 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  76.53 
 
 		 353 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  74.52 
 
 		 352 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  75.24 
 
 		 352 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  77.12 
 
 		 355 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  72.1 
 
 		 342 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  72.82 
 
 		 877 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  72.82 
 
 		 404 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  72.35 
 
 		 429 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  72.82 
 
 		 439 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  72.82 
 
 		 441 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  72.82 
 
 		 404 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  67.51 
 
 		 333 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  66.07 
 
 		 332 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  69.81 
 
 		 339 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  66.88 
 
 		 333 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  65.85 
 
 		 332 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  68.4 
 
 		 341 aa  448  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  67.21 
 
 		 335 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  65.41 
 
 		 332 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  66.56 
 
 		 341 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  65.48 
 
 		 332 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  65.81 
 
 		 332 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  63.9 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  63.81 
 
 		 332 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  61.73 
 
 		 331 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  59.62 
 
 		 331 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  56.21 
 
 		 344 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  56.21 
 
 		 344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  55.56 
 
 		 345 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  51.32 
 
 		 333 aa  335  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  49.53 
 
 		 331 aa  333  3e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  51.84 
 
 		 330 aa  332  6e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  49.44 
 
 		 381 aa  329  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  51.8 
 
 		 333 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  53.8 
 
 		 368 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  44.37 
 
 		 329 aa  262  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  41.91 
 
 		 346 aa  259  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  40.72 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  43.19 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  42.68 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  38.12 
 
 		 336 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  39.45 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  39.09 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  39.14 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  38.92 
 
 		 340 aa  199  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 262 aa  89.7  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  27.51 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 270 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 		 314 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.24 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  27.7 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  42 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 263 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  32.84 
 
 		 278 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  24.29 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  40.57 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  29.75 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  27.72 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  28.4 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  27.17 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  27.57 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 258 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 254 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 		 254 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  27.17 
 
 		 291 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 288 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 290 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>