53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3019 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3019  putative hydrolase  100 
 
 		 224 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3745  putative hydrolase  98.66 
 
 		 224 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  29.09 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  27.9 
 
 		 256 aa  72  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  27.9 
 
 		 256 aa  72  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.56 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  28.51 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  26.52 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  26.96 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  31.47 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  26.96 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  33.33 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  34.52 
 
 		 255 aa  48.5  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 		 262 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 408 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 270 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 290 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 269 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 269 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 		 280 aa  42.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.699138  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.5 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.204345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 280 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5558  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 		 227 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0626  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 		 284 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 408 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 408 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>