More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0978 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
339 aa  683    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  70.55 
 
 
387 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  68.31 
 
 
377 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  67.53 
 
 
344 aa  455  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  69.58 
 
 
406 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  69.9 
 
 
348 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  70.45 
 
 
429 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  68.93 
 
 
353 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  65.77 
 
 
348 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  69.9 
 
 
353 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  68.93 
 
 
387 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  68.93 
 
 
353 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  68.93 
 
 
353 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  68.61 
 
 
352 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  68.28 
 
 
352 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  63.98 
 
 
332 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  64.71 
 
 
332 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  66.88 
 
 
342 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  66.88 
 
 
877 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  66.88 
 
 
441 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  66.88 
 
 
439 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  66.88 
 
 
404 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  66.88 
 
 
404 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  67.43 
 
 
355 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  63.73 
 
 
350 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  63.64 
 
 
335 aa  421  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  63.93 
 
 
332 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  64.06 
 
 
333 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  62.81 
 
 
333 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  63.28 
 
 
332 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  64.05 
 
 
341 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  61.99 
 
 
332 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  61.66 
 
 
332 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  63.31 
 
 
341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  59.42 
 
 
331 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  59.17 
 
 
331 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  58.54 
 
 
345 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  60.33 
 
 
344 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  59.67 
 
 
344 aa  349  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  56 
 
 
368 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  50.33 
 
 
330 aa  324  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  50.68 
 
 
331 aa  322  4e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  48.3 
 
 
333 aa  318  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
333 aa  317  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  49.21 
 
 
381 aa  310  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  41.06 
 
 
346 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  41.54 
 
 
329 aa  258  8e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  42.07 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 
345 aa  232  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 
336 aa  218  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 
336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 
340 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  39.74 
 
 
334 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  40.67 
 
 
340 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  40.58 
 
 
343 aa  202  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  31.63 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  48 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  39.57 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.57 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  36.21 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  43.02 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  39.09 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  43 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  34.76 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.2 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  43.56 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.93 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.84 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
288 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  36.31 
 
 
518 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  43.02 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  30.8 
 
 
261 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>