More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2147 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
350 aa  726    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  69.11 
 
 
332 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  73.05 
 
 
335 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  68.81 
 
 
332 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  68.09 
 
 
332 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  68.77 
 
 
332 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  66.77 
 
 
341 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  70.26 
 
 
332 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  69.61 
 
 
332 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  66.03 
 
 
353 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  64.63 
 
 
353 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  63.21 
 
 
429 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  63.16 
 
 
377 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  65.15 
 
 
387 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  64.63 
 
 
353 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  63.01 
 
 
342 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  64.31 
 
 
877 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  64.52 
 
 
353 aa  431  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  62.94 
 
 
406 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  64.95 
 
 
352 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  64.31 
 
 
439 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  63.78 
 
 
333 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  64.31 
 
 
404 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  64.31 
 
 
352 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  64.31 
 
 
404 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  64.31 
 
 
441 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  63.73 
 
 
339 aa  425  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  62.26 
 
 
344 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  61.04 
 
 
387 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  61.36 
 
 
348 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  64.17 
 
 
348 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  61.54 
 
 
333 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  62.58 
 
 
341 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  61.11 
 
 
355 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  55.99 
 
 
331 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  55.65 
 
 
331 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  51.91 
 
 
333 aa  343  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  48.18 
 
 
331 aa  339  5e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  54.46 
 
 
344 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  54.46 
 
 
344 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  54.67 
 
 
345 aa  332  8e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  53.8 
 
 
368 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  49.23 
 
 
330 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  50.16 
 
 
381 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  49.01 
 
 
333 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  45.2 
 
 
329 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  48.37 
 
 
346 aa  285  9e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  41.28 
 
 
330 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 
336 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 
345 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 
336 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  38.51 
 
 
334 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 
343 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  37.79 
 
 
340 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 
340 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  44 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 
308 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  37.76 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 
331 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  39.17 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
271 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  37.84 
 
 
278 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  38.33 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  34.87 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  39.78 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
337 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  28.21 
 
 
518 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  23.55 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>