More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0611 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 346 aa  713    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  50.85 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  47.7 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  47.54 
 
 		 381 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  48.37 
 
 		 350 aa  285  9e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  48.99 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  47.49 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  48.16 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  47.12 
 
 		 330 aa  281  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 		 368 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  47.16 
 
 		 344 aa  278  7e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  44.25 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  46.73 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  46.65 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  46.6 
 
 		 331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  45.22 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  46.93 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  46.53 
 
 		 341 aa  270  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  46.03 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  46.76 
 
 		 348 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  46.56 
 
 		 341 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  45.85 
 
 		 877 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  45.25 
 
 		 429 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  45.85 
 
 		 342 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  45.85 
 
 		 441 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  44.77 
 
 		 333 aa  262  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  45.85 
 
 		 404 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  45.85 
 
 		 439 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  45.85 
 
 		 404 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  46.69 
 
 		 332 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  44.77 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  46.76 
 
 		 348 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  44.16 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  44.85 
 
 		 339 aa  258  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  42.56 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  43.15 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  45.18 
 
 		 352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  45.37 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  44.85 
 
 		 353 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  44.59 
 
 		 355 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  44.85 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 		 353 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 		 353 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  44.19 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  42.3 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  43.71 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  35.49 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  39.26 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 336 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  33.8 
 
 		 334 aa  165  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  31.31 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  35.4 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  34.51 
 
 		 290 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  23.76 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  33.63 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  33.63 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  33.63 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  33.63 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  34.51 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  34.29 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  33.63 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  34.48 
 
 		 518 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  33.63 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  34.92 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  32.86 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  34.4 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  32.88 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  32.88 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  32.86 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  32.88 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  34.35 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  32.88 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  34.35 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  36.11 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11931  Alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  23.76 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>