51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3745 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3745  putative hydrolase  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3019  putative hydrolase  98.66 
 
 		 224 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.757431  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  27.9 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  27.9 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  28.64 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.56 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  26.52 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  27.19 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  27.66 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  25.22 
 
 		 254 aa  62  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  31.87 
 
 		 275 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  26.52 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  33.33 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  31.22 
 
 		 268 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 291 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 408 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 408 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 408 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 279 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.09 
 
 		 262 aa  41.6  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 285 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>