More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5604 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5604  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
268 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  40.61 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  40.53 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 
272 aa  135  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  31.58 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
264 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 
248 aa  99.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  34.35 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  33.97 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  33.6 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  31.11 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
258 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 
251 aa  85.5  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 
254 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  26.71 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  26.71 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.09 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  26.71 
 
 
296 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
266 aa  79  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  32.05 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  31.56 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.35 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  31.44 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.62 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.88 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.68 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.11 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  50.59 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
250 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  41.11 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  27.16 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  28.63 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  32.54 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.36 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
272 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
272 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  26.9 
 
 
272 aa  63.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  26.79 
 
 
281 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
265 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  27.61 
 
 
279 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 
250 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  44.58 
 
 
263 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
272 aa  62.4  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 
273 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  27.74 
 
 
273 aa  62  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  36.08 
 
 
283 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  26.36 
 
 
265 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  37.88 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.43 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  22.46 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  30.22 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  40.22 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  36.96 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  39.13 
 
 
334 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  42.71 
 
 
275 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>