More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1825 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 243 aa  477  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  78.75 
 
 		 243 aa  380  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  28.02 
 
 		 274 aa  88.6  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 272 aa  85.5  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 324 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  24.68 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  27.86 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  25.22 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  28.79 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  25.22 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  33.62 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0910  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0886  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4362  alpha/beta hydrolase fold protein  43.75 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  25.74 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  30.05 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  24.81 
 
 		 322 aa  75.5  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  26.56 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 		 277 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  38.38 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  31.17 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  24.42 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  30.35 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  27.53 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  28.89 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  38.76 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.38 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  38.74 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  42.42 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  41.23 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 308 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 302 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  38.05 
 
 		 275 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  35.09 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  38.39 
 
 		 314 aa  71.6  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  37.17 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  31.5 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  37.12 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  25.78 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  27.64 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  25.29 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  24.33 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>