More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7140 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 425 aa  889    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  37.14 
 
 		 286 aa  176  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  39.92 
 
 		 279 aa  176  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  39.42 
 
 		 279 aa  176  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  38.96 
 
 		 226 aa  160  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  37.87 
 
 		 267 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  34.45 
 
 		 283 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  39.06 
 
 		 276 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 283 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  35.95 
 
 		 272 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 		 280 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  34.17 
 
 		 281 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  34.47 
 
 		 270 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 270 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0882  alpha/beta hydrolase fold  35.55 
 
 		 298 aa  135  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.16136 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  35.06 
 
 		 270 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 271 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  34.47 
 
 		 270 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 270 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 270 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  36.61 
 
 		 285 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 270 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  32.89 
 
 		 219 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 		 269 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 269 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.98 
 
 		 265 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  35.9 
 
 		 233 aa  120  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 		 279 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  35.38 
 
 		 233 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  33.86 
 
 		 284 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  29.96 
 
 		 247 aa  116  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.27 
 
 		 284 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 287 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.43 
 
 		 262 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  30.34 
 
 		 258 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 270 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 270 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 261 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 234 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 		 282 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  30.89 
 
 		 267 aa  107  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.06 
 
 		 270 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  29.17 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0378  alpha/beta fold family hydrolase  27.83 
 
 		 244 aa  104  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 270 aa  103  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  29.3 
 
 		 220 aa  103  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  27.38 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.8 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  44.96 
 
 		 265 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 273 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 284 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 265 aa  99.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 310 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  26.98 
 
 		 265 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 263 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 277 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 		 263 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 397 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  43.51 
 
 		 265 aa  96.3  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 		 271 aa  96.3  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 270 aa  96.3  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 		 263 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 253 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 280 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 280 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 266 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 287 aa  94  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 268 aa  94  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 309 aa  93.6  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 297 aa  93.2  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 265 aa  92.8  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 280 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 279 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  43.75 
 
 		 259 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  29.96 
 
 		 265 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 284 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  25.43 
 
 		 239 aa  90.9  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 273 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 276 aa  90.5  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  29.02 
 
 		 262 aa  89.7  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 		 273 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 323 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.43 
 
 		 272 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 291 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 291 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  26.15 
 
 		 263 aa  89.4  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 264 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 291 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 280 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.74 
 
 		 263 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  27.52 
 
 		 283 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 326 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 300 aa  87.8  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>