More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6375 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  100 
 
 
296 aa  614  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  98.31 
 
 
296 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  37.09 
 
 
295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  38.57 
 
 
346 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  37.55 
 
 
369 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  40.27 
 
 
305 aa  188  8e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  36.67 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  34.17 
 
 
304 aa  183  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  36.14 
 
 
292 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  34.4 
 
 
286 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  37.69 
 
 
323 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  39.77 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  36.65 
 
 
300 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  36.62 
 
 
300 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  38.4 
 
 
299 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  36.52 
 
 
306 aa  168  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  36.4 
 
 
319 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  38.58 
 
 
320 aa  166  5e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  36.75 
 
 
300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  34.89 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  35 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  35.09 
 
 
348 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  38.8 
 
 
313 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  34.72 
 
 
297 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  33.1 
 
 
303 aa  159  6e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  31.32 
 
 
339 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  32.04 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  30.14 
 
 
303 aa  125  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  29.11 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  27.24 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  31.91 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  28.72 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  29 
 
 
306 aa  108  8.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  33.46 
 
 
297 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  27.14 
 
 
301 aa  106  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 
292 aa  103  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  32.32 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  27.99 
 
 
286 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  25.93 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  26.18 
 
 
296 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  24.54 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  27.43 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  28.94 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.97 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  27.97 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  27.25 
 
 
323 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  28.01 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.89 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  28.01 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.89 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  26.14 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  27.54 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  24.67 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.76 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  27.36 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
431 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  24.26 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  27.74 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  28.21 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  26.18 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  26.52 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  23.1 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  26.6 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.73 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3629  Alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611576  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  23.86 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.27 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  24.39 
 
 
306 aa  68.9  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  28.27 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.15 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  26.34 
 
 
282 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  23.86 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  37.23 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  26.73 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  23.86 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>