More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1162 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 304 aa  597  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  65.66 
 
 		 304 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  63.97 
 
 		 304 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  60.54 
 
 		 305 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  63.64 
 
 		 304 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  63.64 
 
 		 304 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  59.34 
 
 		 306 aa  338  7e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  52.54 
 
 		 310 aa  295  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  44.67 
 
 		 309 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  44.67 
 
 		 309 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  45.02 
 
 		 309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 		 321 aa  218  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  28.93 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  37.41 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  35.27 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  34.96 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  30.71 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  29.39 
 
 		 295 aa  103  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  29.58 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 586 aa  89.7  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 282 aa  87  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 		 275 aa  85.9  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  27.46 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0334  alpha/beta hydrolase  28.41 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  29.32 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  22.66 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  22.66 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  22.3 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  22.3 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  22.3 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  39.22 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  22.3 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  39.22 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  24.2 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  22.3 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04010  hypothetical protein  34.33 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.439585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  33.61 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.66 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  38.24 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  36.27 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.58 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  34.35 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  37.41 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  38.24 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  26.17 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.3 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  34.35 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  27.88 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  35.54 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  25.5 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0189  alpha/beta family hydrolase  28.78 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  34.25 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  25.83 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  28.62 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  32.2 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  30.16 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  32.82 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  30.47 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  31.58 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  26.6 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  23.78 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01230  proline iminopeptidase  31.5 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  36.45 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  29.77 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44260  predicted protein  39.58 
 
 		 368 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  28.91 
 
 		 313 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>