211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3836 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 298 aa  584  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0425  alpha/beta hydrolase fold protein  50.71 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  37.33 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  37.37 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0814  alpha/beta hydrolase fold protein  41.33 
 
 		 279 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0516  alpha/beta hydrolase fold protein  36.77 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241118 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1109  alpha/beta hydrolase fold protein  39.53 
 
 		 248 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  29.68 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2649  alpha/beta hydrolase fold  35.84 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0585324  hitchhiker  0.00353536 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  32.16 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  29.41 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  31.74 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2217  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  30.72 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1870  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11215  hypothetical protein  30.69 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00309878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0514  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 302 aa  96.3  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  33.69 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  34.39 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4760  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  39.1 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0083  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2997  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2706  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2750  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2736  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400855  normal  0.0807859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0077  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.775579  normal  0.0946583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3128  alpha/beta hydrolase fold protein  33 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9213  alpha/beta family hydrolase  33.33 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1983  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0775049  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.68 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  28.37 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  27.04 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  28.63 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  21.83 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  27.98 
 
 		 255 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2896  Alpha/beta hydrolase fold  37.6 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.144018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0557  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 		 282 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 263 aa  52.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  29.18 
 
 		 329 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2975  Alpha/beta hydrolase  29.84 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  26.86 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  30.9 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2425  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 349 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  29.81 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0138  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04010  hypothetical protein  32.76 
 
 		 546 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.439585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  31.17 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2213  alpha/beta hydrolase fold protein  26.78 
 
 		 280 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 		 311 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 288 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 297 aa  48.9  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  25.93 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44260  predicted protein  24.36 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2136  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.74 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.264144  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  24.39 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4348  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  30 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  31.22 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1064  alpha/beta fold family hydrolase  28.11 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  44.19 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  32.48 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>