More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2425 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2425  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 290 aa  564  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3427  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.16542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6028  alpha/beta hydrolase fold protein  39.86 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  33.69 
 
 		 320 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  32.86 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1694  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 277 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0287329  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  27.56 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  30.94 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  34.51 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  33.02 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.37 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  26.91 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4759  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00472864  normal  0.0179653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.95 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  22.1 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 		 270 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1656  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  33.63 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2427  alpha/beta hydrolase fold protein  26.9 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  31.82 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6064  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05450  putative hydrolase signal peptide protein  24.27 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.111492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.83 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.09 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  24.31 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  29.97 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  27.37 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2114  alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.502717  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0311  alpha/beta hydrolase  34.35 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  31.19 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.27 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 254 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  26.1 
 
 		 277 aa  53.1  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 248 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>