157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6028 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6028  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 317 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2425  alpha/beta hydrolase fold protein  39.66 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3427  alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.16542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  44.22 
 
 		 368 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  34.75 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  29.5 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  27.94 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.97 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  28.26 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 		 269 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3444  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0648786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0586  alpha/beta hydrolase fold protein  36.8 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  27.08 
 
 		 270 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  40.7 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 271 aa  53.5  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 264 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  34.73 
 
 		 263 aa  52.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  26.22 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  28.88 
 
 		 268 aa  50.1  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 315 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 315 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  22.56 
 
 		 273 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2314  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75454  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  45.07 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  24 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  37.62 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  28.18 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  22.88 
 
 		 295 aa  47  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 341 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  29.74 
 
 		 254 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  28.45 
 
 		 285 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.13 
 
 		 262 aa  46.6  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 		 248 aa  46.6  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  30.56 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 270 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 308 aa  46.2  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  47.06 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 		 337 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  41.51 
 
 		 280 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  23.94 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  37.5 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  29.38 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1931  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 282 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  34.19 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  30.37 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  26.09 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2357  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0142155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  38.66 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  25.23 
 
 		 510 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  30.19 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  37.21 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  29.81 
 
 		 233 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1709  homoserine O-acetyltransferase  47.73 
 
 		 379 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.980413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  40.54 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>