More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3427 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3427  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 304 aa  610  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.16542  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2425  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6028  alpha/beta hydrolase fold protein  34.32 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 		 350 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.38 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  22.52 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  37.6 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  22.55 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.6 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  22.52 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  25.59 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  29.48 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  41.67 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  41.67 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  41.67 
 
 		 256 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  22.65 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  28.78 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  24.07 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  29.74 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  21.47 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  26.28 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  26.95 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.15 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0586  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  38.83 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  25.7 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  43.24 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  27.14 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.72 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.15 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  38.78 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  27.81 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  25.43 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  21.72 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  26.79 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  30.92 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.3 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  27.78 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  27.46 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  27.88 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.25 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  36.7 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  26.81 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  28.72 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  39.6 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  37.86 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  26.81 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>