More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2058 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
292 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 
290 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  41.58 
 
 
307 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  39.46 
 
 
290 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 
290 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  39.18 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  40.28 
 
 
284 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 
294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  37.23 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
298 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 
302 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.01 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 
298 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  38.37 
 
 
300 aa  138  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  36.27 
 
 
277 aa  138  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  35.42 
 
 
323 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  32.43 
 
 
300 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 
284 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  32.05 
 
 
300 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  29.62 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  36.15 
 
 
289 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  36.84 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  38.1 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
289 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  26.94 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 
282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  39.53 
 
 
335 aa  128  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  34.02 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  36.76 
 
 
323 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 
298 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 
330 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 
308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 
292 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
302 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
297 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  35.89 
 
 
312 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  38.58 
 
 
279 aa  122  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  34.43 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  28.92 
 
 
626 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 
274 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  28.24 
 
 
607 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  34.9 
 
 
274 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  31.03 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
306 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  34.47 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 
304 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 
292 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  24.51 
 
 
283 aa  108  7.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 
319 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  32.26 
 
 
378 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  32.26 
 
 
325 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  32.26 
 
 
448 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  32.26 
 
 
448 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  31.85 
 
 
448 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  31.85 
 
 
448 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  33.69 
 
 
274 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  31.85 
 
 
421 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  32.93 
 
 
301 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
283 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 
295 aa  99.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  34.49 
 
 
274 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  32.16 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  30.42 
 
 
305 aa  89.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.14 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  29.79 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.4 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  27.17 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  28.9 
 
 
276 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3427  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.16542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  28.9 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  38.1 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
320 aa  63.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
280 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  26.59 
 
 
265 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 
250 aa  63.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.5 
 
 
282 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>