171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2704 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
309 aa  628  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  77.27 
 
 
306 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  66.23 
 
 
299 aa  411  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  63.41 
 
 
311 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  60.19 
 
 
319 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  61.51 
 
 
311 aa  378  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  63.25 
 
 
292 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  58.39 
 
 
330 aa  362  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  57.14 
 
 
335 aa  358  7e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  56.03 
 
 
296 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  57 
 
 
300 aa  316  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  49.35 
 
 
323 aa  289  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  47.71 
 
 
294 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  50.98 
 
 
289 aa  278  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  50.33 
 
 
289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  47.4 
 
 
293 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  47.68 
 
 
284 aa  256  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  44.59 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  44.12 
 
 
306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  44.59 
 
 
298 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  44.26 
 
 
298 aa  248  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  42.48 
 
 
304 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  43.61 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  43.61 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  43.61 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  43.61 
 
 
298 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  43.51 
 
 
323 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  39.33 
 
 
626 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  43.79 
 
 
301 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  43.79 
 
 
325 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  43.79 
 
 
378 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  43.79 
 
 
448 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  43.79 
 
 
448 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  43.79 
 
 
448 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  43.79 
 
 
421 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  41.83 
 
 
304 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  43.46 
 
 
448 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  39.67 
 
 
607 aa  225  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  44.33 
 
 
312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  39.74 
 
 
287 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  44.33 
 
 
302 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  42.77 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 
283 aa  189  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  28.97 
 
 
284 aa  170  3e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  33.11 
 
 
300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  33.44 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  37.29 
 
 
279 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  29.41 
 
 
283 aa  160  4e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  36.58 
 
 
295 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  30.2 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  36.01 
 
 
292 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 
292 aa  135  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  34.12 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  34.58 
 
 
274 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 
274 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  35.69 
 
 
275 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 
302 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  32.5 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 
290 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 
307 aa  116  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
292 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
290 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
290 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  31.91 
 
 
274 aa  105  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
299 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  31.34 
 
 
297 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
282 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  32.32 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 
298 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 
288 aa  86.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
300 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  27.48 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  32.27 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  31.14 
 
 
277 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  32.64 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  27.86 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  27.78 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>