More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2243 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 274 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  85.4 
 
 		 274 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  85.04 
 
 		 274 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  71.96 
 
 		 275 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  65.2 
 
 		 274 aa  348  7e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  52 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  47.84 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  41.58 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  35.84 
 
 		 307 aa  150  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  39.41 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  40.78 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  35.84 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 		 294 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  35.97 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  38.6 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 		 290 aa  141  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  37.28 
 
 		 298 aa  141  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  35.21 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  37.85 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  34.97 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  40.3 
 
 		 330 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 		 290 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  37.14 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  37.83 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  34.65 
 
 		 626 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  30.15 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 311 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  38.25 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  34.98 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  33.86 
 
 		 607 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  37.55 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  36.97 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  38.15 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  37.55 
 
 		 448 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  37.55 
 
 		 448 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  37.55 
 
 		 378 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  37.4 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  28.63 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  35.13 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  35.13 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  35.13 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  37.92 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  37.17 
 
 		 448 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  33.46 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  37.17 
 
 		 421 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  37.17 
 
 		 448 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  35.25 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  36.88 
 
 		 289 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  33.69 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 		 292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  29 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  36.86 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  34.59 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  28.25 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  25.81 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  35.4 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  30.77 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.46 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  34.38 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.21 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  41.74 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.18 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  38.67 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>