More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0827 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  85.2 
 
 		 607 aa  1024    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 626 aa  1288    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  53.9 
 
 		 294 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  52.35 
 
 		 323 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  51.44 
 
 		 306 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  50.72 
 
 		 298 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  50.72 
 
 		 298 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  50.72 
 
 		 298 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  50.36 
 
 		 298 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  49.64 
 
 		 297 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 298 aa  298  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  49.28 
 
 		 304 aa  298  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  50.36 
 
 		 298 aa  296  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  49.28 
 
 		 289 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  50.35 
 
 		 293 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  50.72 
 
 		 304 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  48.56 
 
 		 289 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  49.64 
 
 		 325 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  49.64 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  49.64 
 
 		 378 aa  271  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  49.64 
 
 		 448 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  44.25 
 
 		 296 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  49.64 
 
 		 448 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  49.64 
 
 		 448 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  49.28 
 
 		 301 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  49.64 
 
 		 448 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  44.6 
 
 		 300 aa  263  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  44.07 
 
 		 311 aa  252  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  47.54 
 
 		 325 aa  250  7e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  43.39 
 
 		 311 aa  248  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0726  cation efflux protein  53.61 
 
 		 313 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.951048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  42.62 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  47.19 
 
 		 339 aa  243  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  44.6 
 
 		 284 aa  243  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  41.33 
 
 		 330 aa  238  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  42.36 
 
 		 323 aa  237  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  41.52 
 
 		 299 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  39.33 
 
 		 309 aa  233  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  45.04 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  39.68 
 
 		 319 aa  232  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  41.99 
 
 		 302 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1727  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  44.15 
 
 		 297 aa  219  7.999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0460  cation efflux system protein CzcD  44.15 
 
 		 297 aa  220  7.999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 		 292 aa  219  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  40.07 
 
 		 287 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  40.55 
 
 		 299 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  43.01 
 
 		 312 aa  211  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  43.01 
 
 		 312 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  43.01 
 
 		 312 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  39.86 
 
 		 299 aa  211  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  43.15 
 
 		 312 aa  210  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 299 aa  210  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4118  cation diffusion facilitator family transporter  44.18 
 
 		 325 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4276  cation efflux protein  44.18 
 
 		 325 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 		 312 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  39.66 
 
 		 299 aa  207  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  42.55 
 
 		 342 aa  207  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 314 aa  206  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  41.82 
 
 		 315 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  44.18 
 
 		 312 aa  203  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  44.18 
 
 		 312 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  41.82 
 
 		 307 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  44.18 
 
 		 312 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  44.18 
 
 		 312 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  44.18 
 
 		 312 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 		 283 aa  201  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  35.18 
 
 		 316 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  41.24 
 
 		 286 aa  200  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  39.15 
 
 		 305 aa  200  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  42.45 
 
 		 327 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  38.64 
 
 		 340 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  39.86 
 
 		 295 aa  198  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  39.72 
 
 		 326 aa  197  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  41.2 
 
 		 305 aa  197  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.78 
 
 		 299 aa  197  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  39.78 
 
 		 299 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  39.78 
 
 		 299 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  39.6 
 
 		 310 aa  195  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  39.78 
 
 		 299 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 		 311 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  39.2 
 
 		 333 aa  192  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  39.18 
 
 		 299 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  40.32 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  41.56 
 
 		 316 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  42.75 
 
 		 313 aa  187  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  42.36 
 
 		 310 aa  187  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  38.52 
 
 		 327 aa  185  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  35.94 
 
 		 305 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1256  zinc transporter ZitB  40.4 
 
 		 321 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  38.91 
 
 		 298 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  35.87 
 
 		 300 aa  183  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  35.51 
 
 		 300 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0154  cation diffusion facilitator family transporter  36.58 
 
 		 319 aa  183  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.618945  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0159  cation diffusion facilitator family transporter  36.58 
 
 		 319 aa  183  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  36.34 
 
 		 342 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  33.73 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  40.36 
 
 		 315 aa  179  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  36.49 
 
 		 299 aa  178  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  41.3 
 
 		 328 aa  178  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  36.84 
 
 		 347 aa  176  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>