More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2831 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
284 aa  588  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  60 
 
 
323 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  56.79 
 
 
323 aa  319  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  54.93 
 
 
294 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  53.36 
 
 
306 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  54.39 
 
 
298 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  54.04 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  55.09 
 
 
298 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  52.98 
 
 
298 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  52.98 
 
 
298 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  52.98 
 
 
298 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  54.84 
 
 
289 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  52.23 
 
 
296 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  51.94 
 
 
304 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  55.2 
 
 
289 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  52.28 
 
 
298 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  53.93 
 
 
286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  53 
 
 
421 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  53 
 
 
448 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  53 
 
 
325 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  53 
 
 
448 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  53 
 
 
378 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  53 
 
 
448 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  53.36 
 
 
301 aa  278  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  52.65 
 
 
448 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  52.82 
 
 
293 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  51.24 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  52.65 
 
 
300 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  48.8 
 
 
292 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  42.91 
 
 
287 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  47.85 
 
 
311 aa  256  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  47.68 
 
 
309 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  47.19 
 
 
311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  47.77 
 
 
299 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  45.74 
 
 
302 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
335 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  44.6 
 
 
626 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  45.33 
 
 
306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  45.72 
 
 
330 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  41.16 
 
 
283 aa  236  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  43.17 
 
 
607 aa  235  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  44.19 
 
 
319 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  42.2 
 
 
312 aa  228  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  42.35 
 
 
300 aa  225  7e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  42.35 
 
 
300 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  45.16 
 
 
279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  39.22 
 
 
284 aa  206  3e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  37.31 
 
 
283 aa  205  7e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  41.1 
 
 
292 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  41.1 
 
 
292 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  40.73 
 
 
295 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  31.6 
 
 
285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 
302 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  39.03 
 
 
284 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  35.52 
 
 
305 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 
274 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  38.38 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
290 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  35.91 
 
 
297 aa  139  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 
292 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 
299 aa  136  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 
290 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  33.96 
 
 
275 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
274 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 
307 aa  128  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  33.82 
 
 
274 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  35.27 
 
 
295 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  34.22 
 
 
298 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  34.5 
 
 
290 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  33.96 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 
298 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 
308 aa  102  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.21 
 
 
285 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
270 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 
289 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
267 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
300 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
327 aa  85.5  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  29.33 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.84 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.57 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  22.1 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  24.35 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  28.41 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  27.9 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>