More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0785 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 302 aa  610  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  60.63 
 
 		 312 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  54.81 
 
 		 323 aa  285  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  51.44 
 
 		 286 aa  268  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  44.65 
 
 		 287 aa  261  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  47.2 
 
 		 323 aa  249  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  46.05 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  45.74 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  47.95 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  44.07 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  47.27 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  47.27 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  47.27 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  41.92 
 
 		 300 aa  239  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  49.29 
 
 		 330 aa  235  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  48.75 
 
 		 279 aa  234  9e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  39.93 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  46.55 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  45.82 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  45.09 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  41.99 
 
 		 626 aa  229  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  44.64 
 
 		 299 aa  228  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  43.57 
 
 		 304 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  47.69 
 
 		 289 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  45.36 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  47.6 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  47.69 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  47.14 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  45.36 
 
 		 292 aa  221  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  43.6 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  48.04 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  42.28 
 
 		 607 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  44.33 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  45.74 
 
 		 335 aa  212  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  42.11 
 
 		 319 aa  208  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  41.79 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  34.53 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  43.96 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  43.75 
 
 		 325 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  43.75 
 
 		 421 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  43.59 
 
 		 448 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  43.59 
 
 		 448 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  43.59 
 
 		 378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  43.59 
 
 		 448 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  43.59 
 
 		 448 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  34.21 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  43.68 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  39.85 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  35.51 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  39.5 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  36.86 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  36.25 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  33.21 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  34.27 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  36.06 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  35.27 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  33.21 
 
 		 274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  34.5 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  36.18 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  31.92 
 
 		 274 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  31.09 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  29.43 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  28.57 
 
 		 2762 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  30.08 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  30.07 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>