More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1033 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 280 aa  545  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  45.99 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  47.31 
 
 		 303 aa  227  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  46.67 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  46.67 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  46.67 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  47.76 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  45.63 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  46.88 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  46.88 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  46.88 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  43.53 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  44.84 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  44.26 
 
 		 299 aa  208  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  48.8 
 
 		 305 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  42.07 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  42.07 
 
 		 300 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  41.85 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  43.53 
 
 		 286 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  46.3 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  42.97 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  45.29 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  43.01 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  42.81 
 
 		 294 aa  181  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  40.51 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  41.73 
 
 		 288 aa  178  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  39.49 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  40.15 
 
 		 301 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  39.51 
 
 		 303 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  35.98 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  35.98 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  32.34 
 
 		 408 aa  95.9  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 298 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 298 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 326 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 298 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  28.94 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  32.72 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  31.11 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  27.24 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  27.95 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28822  predicted protein  32.11 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.64 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  26.82 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  33.72 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  27.27 
 
 		 2762 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  22.64 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  22.64 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  31.95 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  28.14 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1050  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.173196  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2094  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  41.07 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  26.09 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  23.39 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  29.06 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  25.09 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  24.79 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>