More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1365 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 290 aa  586  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  50.55 
 
 		 285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  47.52 
 
 		 291 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  49.45 
 
 		 288 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  46.3 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  44.67 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  44.67 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  44.67 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  47.55 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  44.1 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  45.04 
 
 		 302 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  45.82 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  45.59 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  42.57 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  43.53 
 
 		 280 aa  209  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  44.29 
 
 		 286 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  45.09 
 
 		 301 aa  208  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  43.57 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  43.57 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  43.57 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  41.81 
 
 		 292 aa  201  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  44.53 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 		 294 aa  195  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  41.18 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 		 294 aa  175  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  41.01 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  39.22 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  38.72 
 
 		 303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  32.95 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  29.3 
 
 		 408 aa  89.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 326 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  33.84 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  26.84 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  30.45 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  26.47 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  27.46 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  30.88 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  26.94 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  27.57 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  27.57 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  25.35 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  27.94 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  25.18 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.09 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  42.11 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  26.35 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  41.23 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  26.64 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  25.93 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  25.59 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0712  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  24.02 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  27.1 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  40.82 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  28.89 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>