More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1777 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  52.3 
 
 		 285 aa  291  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  46.57 
 
 		 286 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  50.36 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  50.72 
 
 		 295 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  50.36 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  50 
 
 		 293 aa  258  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 		 303 aa  258  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  47.84 
 
 		 292 aa  254  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  48.91 
 
 		 289 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  47.52 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  46.5 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  45.26 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  45.61 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  45.61 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  46.64 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  44.95 
 
 		 303 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  44.95 
 
 		 303 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  44.95 
 
 		 303 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  45.58 
 
 		 299 aa  235  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 		 288 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  45.21 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  41.46 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  41.46 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  41.46 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  43.3 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  44.49 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  40.64 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  42.55 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  40.68 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  32.18 
 
 		 408 aa  105  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  25.28 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  24.05 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  26.92 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  26.12 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  23.02 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  30.8 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  22.68 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  22.68 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  22.68 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  23.79 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 		 239 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  28.41 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  24.07 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  25.84 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  20.97 
 
 		 607 aa  66.6  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  25.47 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  26.83 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  28.18 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  28.37 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1644  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.44 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  25.66 
 
 		 2762 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  24.81 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0919  alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  20.56 
 
 		 626 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  22.96 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  27.66 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  25.28 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  27.61 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>