More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5402 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  71.38 
 
 
285 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  46.57 
 
 
291 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  50.35 
 
 
294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  47.6 
 
 
289 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  46.26 
 
 
295 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  45.96 
 
 
301 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  46.64 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  46.64 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  46.64 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  41.2 
 
 
290 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  40.34 
 
 
294 aa  218  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  41.84 
 
 
312 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  41.84 
 
 
312 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  41.84 
 
 
312 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  41.2 
 
 
302 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  43.34 
 
 
300 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  44.29 
 
 
290 aa  210  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  43.43 
 
 
288 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  45.77 
 
 
299 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  44.07 
 
 
302 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  43.82 
 
 
296 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 
292 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  45.74 
 
 
303 aa  205  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  44.72 
 
 
299 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  41.95 
 
 
285 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  43.86 
 
 
293 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  42.36 
 
 
305 aa  201  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  43.53 
 
 
280 aa  192  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  37.99 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  41.06 
 
 
272 aa  158  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  31 
 
 
408 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
298 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
299 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
299 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  30.17 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  26.34 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.32 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  25.17 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  23.3 
 
 
265 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.9 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  39.82 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
270 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
279 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  24.29 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
267 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  24.9 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
339 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
290 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
274 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  33.86 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  27.31 
 
 
299 aa  59.3  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
279 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.27 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  23.31 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  27 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
348 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  21.56 
 
 
311 aa  57  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
316 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
272 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  25.43 
 
 
255 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  26.19 
 
 
259 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  33.07 
 
 
275 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.88 
 
 
425 aa  56.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  25.43 
 
 
255 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  25.43 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
298 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19100  rhamnosyltransferase chain A  23.73 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0158051 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1050  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
322 aa  55.8  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.173196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>