More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3063 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
305 aa  609  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  67.78 
 
 
272 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  43.97 
 
 
291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  46.3 
 
 
294 aa  215  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  44.76 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  45.72 
 
 
303 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  45.72 
 
 
303 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  45.72 
 
 
303 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  44.76 
 
 
299 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  48.45 
 
 
280 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  42.81 
 
 
292 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  42.36 
 
 
286 aa  202  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  40.69 
 
 
294 aa  198  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  43.51 
 
 
300 aa  198  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  42.81 
 
 
296 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  47.08 
 
 
285 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 
290 aa  192  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 
312 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 
312 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 
312 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  42.6 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  43.54 
 
 
303 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  42.53 
 
 
288 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  41.26 
 
 
293 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  42.23 
 
 
302 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  41.76 
 
 
289 aa  176  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  39.3 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  41.22 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  43.19 
 
 
295 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  41.76 
 
 
301 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  39.92 
 
 
303 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  31.32 
 
 
408 aa  91.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  25.55 
 
 
607 aa  85.9  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  31.66 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  24.79 
 
 
626 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35370  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.52 
 
 
261 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  28.74 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  23.11 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28822  predicted protein  26.86 
 
 
386 aa  69.3  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  23.38 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  22.94 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.68 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  28.36 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
257 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5256  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6109  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  28.33 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  26.88 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  25.6 
 
 
253 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.89 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
298 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
298 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
298 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  23.2 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  28.85 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
289 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  26.58 
 
 
304 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
295 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  30.97 
 
 
281 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
299 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  26.13 
 
 
285 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.67 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
266 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  23.48 
 
 
287 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
298 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
265 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
275 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.17 
 
 
277 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>