More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3478 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 295 aa  598  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  80.73 
 
 		 275 aa  449  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  55.56 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4072  alpha/beta hydrolase fold  40.22 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.523651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 		 276 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2310  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3943  alpha/beta fold family hydrolase  30.6 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615663  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3485  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 276 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2141  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0335838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1894  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  29.17 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 248 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  26.24 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  32.12 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.24 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 278 aa  86.3  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  25.89 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  25.89 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0215  alpha/beta family hydrolase  29.5 
 
 		 274 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00842638  normal  0.87662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3578  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 268 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4326  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703871  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4040  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1851  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  22.81 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.62 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  40.65 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  25.86 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  40.65 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  28.79 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.1 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  26.94 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  40.52 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  43.3 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  26.67 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  24.82 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  31.18 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  25.46 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.54 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  22.7 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  22.61 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.05 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4549  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565674  normal  0.972542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  24.82 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  42.98 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0997  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  29.21 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2473  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0409911  normal  0.0604811 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  22.7 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  22.7 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 265 aa  72  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  22.7 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  36.52 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  25.83 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  23.89 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>