188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0997 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0997  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 268 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  29.61 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.97 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  39.77 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 		 274 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 		 276 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  37.21 
 
 		 276 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  38.39 
 
 		 269 aa  52.8  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 294 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 253 aa  52.4  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.55 
 
 		 370 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 		 272 aa  52  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0043  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 		 279 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  37.66 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 		 281 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1389  alpha/beta hydrolase fold protein  43.21 
 
 		 287 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.48672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.31 
 
 		 271 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  50 
 
 		 305 aa  48.9  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  39.73 
 
 		 288 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 		 257 aa  48.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  43.84 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  22.88 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0343  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 372 aa  46.6  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2310  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 285 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.54 
 
 		 370 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  43.86 
 
 		 288 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  48.08 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  41.56 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 		 301 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 		 297 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  43.86 
 
 		 349 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  41.67 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 		 270 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  38.36 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 		 297 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.24 
 
 		 371 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  34.23 
 
 		 268 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 322 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1559  alpha/beta hydrolase fold protein  38.1 
 
 		 284 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0478161  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  25.41 
 
 		 333 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 276 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  46.43 
 
 		 308 aa  45.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.37 
 
 		 372 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.11 
 
 		 371 aa  45.1  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  35.06 
 
 		 290 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  38.67 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 277 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  39.19 
 
 		 285 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4640  hypothetical protein  39.02 
 
 		 280 aa  45.1  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376604  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  34.09 
 
 		 272 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  30 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  24.61 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  31 
 
 		 299 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  41.82 
 
 		 287 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.89 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 284 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.96 
 
 		 369 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.89 
 
 		 371 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5612  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00676484  hitchhiker  0.00203627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3485  alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 		 276 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  41.43 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  36.71 
 
 		 283 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  40.79 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0131  putative hydrolase  27.83 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1228  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 268 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0326  alpha/beta fold family hydrolase  27.22 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  38.67 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 		 264 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  43.86 
 
 		 294 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>