More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2310 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2310  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
264 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2141  alpha/beta hydrolase fold  71.48 
 
 
268 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0335838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3943  alpha/beta fold family hydrolase  70.08 
 
 
268 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615663  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1894  alpha/beta hydrolase fold  70.45 
 
 
268 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  68.85 
 
 
265 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3578  alpha/beta hydrolase fold  69.7 
 
 
268 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.396236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  62.31 
 
 
278 aa  331  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  59.48 
 
 
274 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  59.85 
 
 
276 aa  329  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1851  alpha/beta hydrolase fold  62.41 
 
 
283 aa  319  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0215  alpha/beta family hydrolase  57.99 
 
 
274 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00842638  normal  0.87662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4284  alpha/beta hydrolase fold protein  55.13 
 
 
268 aa  300  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3485  alpha/beta hydrolase fold  55.97 
 
 
276 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4549  alpha/beta hydrolase fold  58.21 
 
 
276 aa  275  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565674  normal  0.972542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4326  alpha/beta hydrolase fold  57.09 
 
 
276 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703871  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4040  alpha/beta hydrolase fold  57.09 
 
 
276 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103708  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  32.7 
 
 
275 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
295 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4072  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
270 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.523651  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  25.94 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  41.88 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  41.88 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  41.88 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  40.17 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  40.17 
 
 
291 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  35.82 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  39.83 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  23.55 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
268 aa  72  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  36.72 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  23.67 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  25.6 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  23.67 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  36.36 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  40.5 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 
327 aa  68.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  33.86 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  35.94 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  35.94 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  41.23 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  38.02 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  35.94 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  35.94 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  24.63 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  34.65 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  40.19 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  37.68 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  35.09 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  36.22 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  36.22 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  25.42 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  34.48 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  38.94 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 
296 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  23.23 
 
 
317 aa  65.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  34 
 
 
294 aa  65.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 
346 aa  65.5  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  23.08 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  26.92 
 
 
312 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  38.66 
 
 
262 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  26.89 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  34.21 
 
 
296 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  36.04 
 
 
300 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 
405 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  27.09 
 
 
255 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  34.21 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>