More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4284 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4284  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 268 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  54.58 
 
 		 274 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  56.65 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  54.58 
 
 		 276 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2141  alpha/beta hydrolase fold  57.41 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0335838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  54.95 
 
 		 278 aa  291  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3943  alpha/beta fold family hydrolase  56.27 
 
 		 268 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0615663  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2310  alpha/beta hydrolase fold  55.13 
 
 		 264 aa  285  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1894  alpha/beta hydrolase fold  54.37 
 
 		 268 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3578  alpha/beta hydrolase fold  57.79 
 
 		 268 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396236 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0215  alpha/beta family hydrolase  53.48 
 
 		 274 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00842638  normal  0.87662 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1851  alpha/beta hydrolase fold  55.26 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3485  alpha/beta hydrolase fold  50.74 
 
 		 276 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4326  alpha/beta hydrolase fold  50.37 
 
 		 276 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703871  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4040  alpha/beta hydrolase fold  50.37 
 
 		 276 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4549  alpha/beta hydrolase fold  51.1 
 
 		 276 aa  244  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565674  normal  0.972542 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 275 aa  92.4  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  36.64 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  41.53 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  40.17 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 338 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  40.16 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  40.17 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  37.98 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  40.6 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1572  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  26.39 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  34.36 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  37.5 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  23.48 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  38.94 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  33.13 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  38.74 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.92 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 292 aa  62  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  36.67 
 
 		 341 aa  62  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  29.19 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  38.94 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  36.75 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  41.12 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  22.55 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  31.25 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  40.74 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  42.31 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  38.81 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  25.74 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  36.44 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  39.25 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  38.39 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>